• Računalna funkcionalna anotacija
• Filogenetsko profiliranje
• Ortologija i paralogija
• Filogenetski profili skupina OMA
• Hijerarhijska klasifikacija sa više oznaka
• Vokabular anotacije
• Slijed rada
• Računanje pouzdanosti anotacija

Vokabular anotacije

Ontologija gena (engl. Gene Ontology, GO) je vokabular koji se korist u dodjeljivanja funkvionalne anotacije genima. Organiziran je kao usmjereni aciklički graf u kojemu svaki pojam može imati više roditelja. Kako bi opisao mnoge aspekte funkcija gena, GO sastoji se od tri zasebne ontologije: “Biološkog procesa” (engl. Biological Process, BP), “Staničnog odjeljka” (engl. Cellular Component, CC) i “Molekularne funkcije” (engl. Molecular Function, MF).

Prilikom dodjeljivanja anotacije OMA grupi koriste se samo anotacije ortolognih gena, dodjeljujući one one anotacije koje su dodijeljene najmanje polovici gena u odgovarajućoj OMA grupi.