• Računalna funkcionalna anotacija
• Filogenetsko profiliranje
• Ortologija i paralogija
• Filogenetski profili skupina OMA
• Hijerarhijska klasifikacija sa više oznaka
• Vokabular anotacije
• Slijed rada
• Računanje pouzdanosti anotacija

Računanje pouzdanosti anotacije

Budući da GORBI ima za cilj pomoći pri anotaciji gena, za svako predviđanje možemo dodijeliti vrijednost ocjene lažnog otkrivanja (engl. False Discovery Rate, FDR). Treba napomenuti da je ova vrijednost izračunata pomoću out-of-bag procjene pogreške, a ne na nezavisnom skupu podataka.
Za svaki pojam GO koji se koristi pri anotaciji možemo izračunati Površinu pod ROC krivuljom (engl. Area Under the Receiver Operating Characteristic curve, AUC). AUC krivulja prikazuje odnos između udjela lažnih predviđanja (engl. False Positive Rate) na X osi i točnih predviđanja (engl. True Positive Rate) na Y osi, opisujući tako relativan odnos između koristi (točnog predviđanja, engl. True Positive) i troška (netočnog predviđanja, engl. False Positive). AUC je ekvivalentan vjerojatnosti da će klasifikator bolje rangirati pozitivan primjer od slučajno odabranog negativnog primjera, te je u osnovi mjera uspješnosti klasifikatora u doznačavanju oznake, u našem slučaju GO anotacije. Svako predviđanje anotacije u GORBI bazi podataka ima pridjeljenu ovakvu statistiku.

FDR se računa za svaki par GO - OMA skupina, preslikava se na gene koje ta OMA skupina sadrži, te je iskazan na stranici sa rezultatima. Definiran je kao omjer broja lažno pozitivnih anotacija (engl. False Positive, FP) - one OMA skupine za koje je klasifikator doznačio pojedinu GO anotaciju, a nisu joj doznačene i broja svih OMA skupina za koje je klasifikator predvidio tu GO anotaciju, bez obzira na njihovu pravu anotaciju.