• Računalna funkcionalna anotacija
• Filogenetsko profiliranje
• Ortologija i paralogija
• Filogenetski profili skupina OMA
• Hijerarhijska klasifikacija sa više oznaka
• Vokabular anotacije
• Slijed rada
• Računanje pouzdanosti anotacija

Hijerarhijska klasifikacija sa više oznaka (engl. Hierarchical multi-label classification)

Primijenili smo algoritam strojnog učenja temeljen na stablima odlučivanja - Hijerarhijska klasifikacija sa više oznaka (engl. Hierarchical multi-label classification - Clus-HMC) - kako bismo predvidjeli GO anotacije skupina ortologa OMA. Clus-HMC je proširenje standardnog algoritma pod nazivom stabla odlučivanja, te je u mogućnosti nositi se s višestrukim, hijerarhijski organiziranim oznakama klase. Algoritam Clus-HMC je proširen (Clus-HMC-ENS) i sada dozvoljava korištenje različitih tehnika kombiniranja osnovnih klasifikatora. U ovom radu koristimo metodu slučajnih šuma (engl. Random Forest, RF tehniku koja se sastoji od mnoštva pojedinačno treniranih stabala odlučivanja. Clus-HMC-ENS algoritam može se slobodno preuzeti.